/Yome/links2020-02-05T14:10:02+01:00http://links.yome.ch/http://links.yome.ch/http://links.yome.ch/Analyses bioinformatiques du coronavirus 2019-nCoV : pourquoi et comment ?http://links.yome.ch/?qBoJuw2020-02-05T14:10:02+01:00Comprendre le coronavirus autrement que par ce qu'on entend via les média et de manière un peu plus scientifique, le tout assez vulgarisé pour que tout le monde puisse y accéder !<br>(<a href="http://links.yome.ch/?qBoJuw">Permalink</a>)Piratage de séquenceurs ADNhttp://links.yome.ch/?JVt0tA2019-06-20T10:45:46+02:00Il va falloir suivre ça de près...<br>(<a href="http://links.yome.ch/?JVt0tA">Permalink</a>)Scientific Workflows for Computational Reproducibility in the Life Sciences: Status, Challenges and Opportunitieshttp://links.yome.ch/?3sunaA2017-06-22T09:48:00+02:00Un super papier sur la reproductibilité en life science.<br>(<a href="http://links.yome.ch/?3sunaA">Permalink</a>)Human data repositoryhttp://links.yome.ch/?qYdRbw2016-11-25T12:09:03+01:00A creuser.<br>(<a href="http://links.yome.ch/?qYdRbw">Permalink</a>)S’outiller et s’organiser pour mieux travailler | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?exGMmw2016-10-05T09:53:59+02:00Un super article sur comment assurer la reproductibilité des données et des expériences en sciences !<br>(<a href="http://links.yome.ch/?exGMmw">Permalink</a>)Genomics notebookshttp://links.yome.ch/?vjg0Dg2016-08-31T12:17:42+02:00Un super repo contenant tout plein de notebooks sur la genomique !<br />
Génial.<br />
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Via le luxembourgeois <a href="http://links.tiyo.eu/?ZJvobg" rel="nofollow">http://links.tiyo.eu/?ZJvobg</a><br>(<a href="http://links.yome.ch/?vjg0Dg">Permalink</a>)Gene name errors are widespread in the scientific literature | Genome Biology | Full Texthttp://links.yome.ch/?EQJa6A2016-08-24T09:37:38+02:00Excel et bioinfo ne font pas bon méngae, mais bon depuis le temps qu'on le dit...<br />
Du coup on se retrouve avec potentiellement 19,6% des analyses faussés à cause d'un con de soft qui se permet de renommer tes cases sans ton consentement parce que c'est surement mieux comme il fait lui...<br />
Je rêve d'un jour où les biologistes n'utiliseront plus Excel :)<br>(<a href="http://links.yome.ch/?EQJa6A">Permalink</a>)The Roots of Bioinformatics in Theoretical Biologyhttp://links.yome.ch/?JFiTzQ2016-04-18T13:50:17+02:00Les débuts de la bioinfo expliqués par une de ses "inventrices" !<br>(<a href="http://links.yome.ch/?JFiTzQ">Permalink</a>)An Introduction to Applied Bioinformaticshttp://links.yome.ch/?1ITX9A2016-03-10T13:17:11+01:00Un tuto pour découvrir la bioinfo.<br />
A test.<br>(<a href="http://links.yome.ch/?1ITX9A">Permalink</a>)Recommended books - Bioinformatics.Org Wikihttp://links.yome.ch/?cbV1tA2016-02-04T16:26:28+01:00Lectures recommandées pour bioinformaticien(ne)s<br>(<a href="http://links.yome.ch/?cbV1tA">Permalink</a>)Bioinformatics Curriculum Guidelines: Toward a Definition of Core Competencieshttp://links.yome.ch/?-EActg2016-02-04T16:25:28+01:00Pour le retrouver et le le lire<br>(<a href="http://links.yome.ch/?-EActg">Permalink</a>)Ron Appel, la voix de la science - rts.ch - émissions - violon dinguehttp://links.yome.ch/?Lk_VcA2016-01-25T16:13:06+01:00Un reportage sur le cofondateur du SIB. A regarder plus tard.<br>(<a href="http://links.yome.ch/?Lk_VcA">Permalink</a>)Un scientifique interdit son logiciel en France. Trop d'immigrés, dit-il.http://links.yome.ch/?kmWx0w2015-09-30T20:23:53+02:00Je pars vomir et je reviens...<br>(<a href="http://links.yome.ch/?kmWx0w">Permalink</a>)La bière décodée dans un Hackuarium | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?iFJKCQ2015-06-09T19:42:20+02:00Oui, on peut allier génétique et bières :)<br />
Un kickstarter intéressant à suivre !<br>(<a href="http://links.yome.ch/?iFJKCQ">Permalink</a>)Le Next Generation Sequencing expliqué différementhttp://links.yome.ch/?r7Xf3Q2015-05-19T13:55:02+02:00Quand Justin Bibier et CHuck Norris viennent en aide à la Science :)<br />
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via ademcan aka Papa<br>(<a href="http://links.yome.ch/?r7Xf3Q">Permalink</a>)Labio.fr piraté : demande de rançon et publication de résultats médicaux - Next INpacthttp://links.yome.ch/?r12b_A2015-03-26T19:48:34+01:00On commence a arriver dans le concret là, c'est plus des simples login + mdp, ou des numéros de cb qui fuitent...<br>(<a href="http://links.yome.ch/?r12b_A">Permalink</a>)LaBiotech Map - The Comprehensive European Biotech MapLaBiotech Map | The Comprehensive European Biotech Maphttp://links.yome.ch/?RbV_8A2014-11-12T21:41:56+01:00Carte de quelques gros labos en biologie/génomique/santé dans le monde<br>(<a href="http://links.yome.ch/?RbV_8A">Permalink</a>)heatmap pythonhttp://links.yome.ch/?kHYHZw2014-11-09T11:00:55+01:00Heatmap en python.<br />
Je me le mets de coté et je suis sur que ça en intéressera quelques uns :)<br>(<a href="http://links.yome.ch/?kHYHZw">Permalink</a>)Portrait ADN | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?8ILO1g2014-10-15T11:34:53+02:00Utiliser l'ADN pour produire de l'art, ça aussi c'est fait maintenant !<br>(<a href="http://links.yome.ch/?8ILO1g">Permalink</a>)Le rôle de la bioinformatique dans les labos collaboratifs | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?wQTbSA2014-09-24T10:42:30+02:00Une belle présentation des FabLabs et de leurs cousins les DIYbio.<br>(<a href="http://links.yome.ch/?wQTbSA">Permalink</a>)Cython: votre programme Python mais 100x plus vite | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?-eUvLA2014-09-10T09:55:21+02:00Le Cython expliqué et comparé au Python, avec en cadeau une approche pour la bioinformatique.<br>(<a href="http://links.yome.ch/?-eUvLA">Permalink</a>)ROSALIND | Statistics | Happy Birthday Achievementhttp://links.yome.ch/?sFG-yQ2014-07-25T13:48:49+02:00Pour ceux/celles inscrits sur Rosalind (plateforme d'apprentissage de la bioinformatique par l'exemple), si vous resolvez un problème aujourd'hui vous aurez le droit à un badge "spécial".<br />
Happy birthday Rosalind !<br>(<a href="http://links.yome.ch/?sFG-yQ">Permalink</a>)De l’explosion du tout séquençage à la médecine personnalisée | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?lslQPw2014-05-14T18:31:38+02:00J'ai écris un "petit" billet sur l'explosion du séquençage et tout ce que ça a amené/va amener de bon/mauvais pour la médecine personnalisée. La médecine propre à votre génome, celle du futur (même si on est déjà en plein dedans en fait).<br />
Pour ceux que ça intéresserait...<br>(<a href="http://links.yome.ch/?lslQPw">Permalink</a>)One Tip Per Dayhttp://links.yome.ch/?NnUjJQ2014-05-06T11:21:13+02:00Une belle trouvaille d'Adem (<a href="http://www.ademcan.net/index.php?mode=links&id=20140506100505" rel="nofollow">http://www.ademcan.net/index.php?mode=links&id=20140506100505</a>) pour la bioinfo.<br />
Merci Papa !<br>(<a href="http://links.yome.ch/?NnUjJQ">Permalink</a>)Watson, un système expert en diagnostic | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?om3NTw2014-05-01T10:53:35+02:00On a retrouvé HAL9000 :)<br>(<a href="http://links.yome.ch/?om3NTw">Permalink</a>)Bioinformatician’s Pocket Reference !! | !nfoplatterhttp://links.yome.ch/?Sprn7Q2014-04-13T22:49:37+02:00A regarder plus tard, ensemble de cheatsheets pour bioinformaticiens.<br>(<a href="http://links.yome.ch/?Sprn7Q">Permalink</a>)Internet : paradis de l’autoformation | - Yome -http://links.yome.ch/?u6hnRg2014-02-06T15:32:17+01:00--- Autopub ---<br />
Si comme moi vous aimez apprendre avec ce merveilleux outil qu'est le Net, bonne lecture :)<br>(<a href="http://links.yome.ch/?u6hnRg">Permalink</a>)SIB (Swiss Institute of Bioinformatics) | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?wMR2gA2014-02-05T10:23:45+01:00La success story du Swiss Institute of Bioinformatics :)<br>(<a href="http://links.yome.ch/?wMR2gA">Permalink</a>)http://ds9a.nl/nwunsch/http://links.yome.ch/?fwv62w2014-01-30T09:41:33+01:00Woh ! L'algorithme de Needleman-Wunsch (pour les alignements en bioinformatique entre autre) en JavaScript ! <br />
J'aime beaucoup ! Merci MAx pour la découverte (<a href="https://ithake.eu/shaarli/?tZ8KWw" rel="nofollow">https://ithake.eu/shaarli/?tZ8KWw</a>)<br>(<a href="http://links.yome.ch/?fwv62w">Permalink</a>)Pour mille balles, t’as un génome humain | Tout se passe comme sihttp://links.yome.ch/?lwgoWA2014-01-16T10:11:30+01:00Très bon billet de Marc Robinson-Rechavi sur le devenir et l'avenir du séquençage... <br />
Comme il le dit très bien, GATTACA arrive... (<a href="http://fr.wikipedia.org/wiki/Bienvenue_%C3%A0_Gattaca" rel="nofollow">http://fr.wikipedia.org/wiki/Bienvenue_%C3%A0_Gattaca</a>)<br />
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via <a href="https://ithake.eu/shaarli/?leM4nA" rel="nofollow">https://ithake.eu/shaarli/?leM4nA</a><br>(<a href="http://links.yome.ch/?lwgoWA">Permalink</a>)RencontresPlateformeReNaBi-GO2013PierreLindenbaum-Inria2013http://links.yome.ch/?r5zjLA2014-01-09T10:25:14+01:00Bonne présentation de Pierre Lindenbaum (bioinformaticien).<br />
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via <a href="https://ithake.eu/shaarli/?PR0DTg" rel="nofollow">https://ithake.eu/shaarli/?PR0DTg</a><br>(<a href="http://links.yome.ch/?r5zjLA">Permalink</a>)BIOSERVICES: a Python package to access biological web services programmatically — bioservices 1.2.0 documentationhttp://links.yome.ch/?8n4B7w2013-12-11T14:35:24+01:00Huuum je me mets ça sous le coude, ça sent vraiment très bon :) Et en python en plus !<br>(<a href="http://links.yome.ch/?8n4B7w">Permalink</a>)Introduction aux ontologies | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?UmtFKg2013-12-11T11:11:21+01:00Une ontologie, qu'est-ce que c'est donc ? Réponse ici :)<br>(<a href="http://links.yome.ch/?UmtFKg">Permalink</a>)Frederick Sanger nous a quitté | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?J071LQ2013-11-22T12:28:37+01:00Un grand monsieur est parti... RIP<br>(<a href="http://links.yome.ch/?J071LQ">Permalink</a>)ELIXIR, un savant mélange de pays | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?ysUpIA2013-11-20T09:42:53+01:00On vous explique ce qu'est ELIXIR et pourquoi c'est fait. Vive la Science :)<br>(<a href="http://links.yome.ch/?ysUpIA">Permalink</a>)France latest country to join ELIXIR | ELIXIRhttp://links.yome.ch/?WpfUuw2013-11-12T21:15:31+01:00Putain enfin ! La France rejoint le projet ELIXIR, quasiment dans les derniers mais ça va amener beaucoup de bonnes choses à la Recherche française, du moins du coté bioinformatique.<br>(<a href="http://links.yome.ch/?WpfUuw">Permalink</a>)Fabriquer un trackhub dans UCSC | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?pRdXPg2013-11-06T09:40:26+01:00J'ai fais un petit tuto sur comment fabriquer un trackhub dans UCSC sur <a href="http://bioinfo-fr.net" rel="nofollow">http://bioinfo-fr.net</a>. <br />
Ça interessera surtout ceux qui manipulent des données génomiques et qui souhaite avoir un bon moyen de les visualiser/comparer. (bioinformaticiens/biologistes)<br />
Enjoy.<br>(<a href="http://links.yome.ch/?pRdXPg">Permalink</a>)oneliners pour la bioinfohttp://links.yome.ch/?E57jow2013-11-01T12:45:08+01:00Je me garde ça sous le coude<br />
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via <a href="https://ithake.eu/shaarli/?d6F1aA" rel="nofollow">https://ithake.eu/shaarli/?d6F1aA</a><br>(<a href="http://links.yome.ch/?E57jow">Permalink</a>)Un bookmarklet pour accéder plus facilement aux publications | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?3x-zZw2013-10-30T09:32:24+01:00Max (<a href="http://ithake.eu" rel="nofollow">http://ithake.eu</a>) nous apprend à faire un bookmarklet pour les portails de publications scientifique<br>(<a href="http://links.yome.ch/?3x-zZw">Permalink</a>)Analyses rapides de fichiers | bioinfo-fr.nethttp://links.yome.ch/?lWud6g2013-10-16T09:43:07+02:00Nous sommes des bioinformaticiens mais nous utilisons des outils d'informaticiens.<br />
Ainsi, un rapide rappel sur les commandes bash que sont "wc", "awk", "sed", "cut" et qui nous sont utiles tous les jours dans nos pipelines de scripts.<br />
Utile pour les débutants et ne fera pas de mal aux confirmés :)<br>(<a href="http://links.yome.ch/?lWud6g">Permalink</a>)